Ion Torrent Genexus 純化系統(tǒng)能夠在短短兩小時(shí)內(nèi)從各種類型樣本中自動(dòng)提取核酸，包括福爾馬林固定石蠟包埋 (FFPE) 裂解物、血漿、全血、新鮮或冷凍組織、外周血白細(xì)胞 (PBL)、培養(yǎng)細(xì)胞和骨髓穿刺物。系統(tǒng)耗材預(yù)填充有試劑，每次運(yùn)行可支持多達(dá) 12 份樣品（從血漿提取的 6 份樣品）。系統(tǒng)包括一臺(tái)機(jī)載 Qubit 熒光計(jì)，可實(shí)現(xiàn)萃取后的自動(dòng)化核酸定量分析，并經(jīng)過(guò)驗(yàn)證可使用 Genexus 集成測(cè)序系統(tǒng)，作為從標(biāo)本至得出結(jié)果的完整工作流程中的一環(huán)。
Genexus 純化系統(tǒng)可提供：
•MagMAX 技術(shù)—得出一致的萃取結(jié)果
• 預(yù)填充的耗材—有助于縮短手動(dòng)處理時(shí)間
• 可視化系統(tǒng)—運(yùn)行設(shè)置期間可提供有關(guān)耗材的實(shí)時(shí)反饋，以防止設(shè)置錯(cuò)誤
• 集成的核酸定量分析—縮短運(yùn)行后處理時(shí)間
Genexus 純化系統(tǒng)在 Genexus 集成測(cè)序儀上使用時(shí)，可實(shí)現(xiàn)多種組織類型的自動(dòng)化核酸萃取和定量分析。該純化系統(tǒng)具有單個(gè)觸點(diǎn)和 10 分鐘的手動(dòng)操作時(shí)間，可從 FFPE 裂解物中按順序提取 DNA 和 RNA，從血漿中提取 cfTNA，以及從全血、新鮮或冷凍組織、骨髓或外周血白細(xì)胞中單獨(dú)提取 DNA 或 RNA。Genexus 軟件連接至集成測(cè)序儀后，可集成從設(shè)置到報(bào)告的工作流程至單個(gè)軟件生態(tài)系統(tǒng)中，實(shí)現(xiàn)下一代測(cè)序 (NGS) 工作流程的簡(jiǎn)化。
預(yù)填充試劑
Genexus 純化系統(tǒng)耗材預(yù)填充有執(zhí)行萃取所必需的大多數(shù)試劑，因此每份樣品僅需很少的移液步驟即可設(shè)置運(yùn)行。只需移除箔封，添加酶和您的樣品，然后將耗材放置在儀器上。
可視化系統(tǒng)
就像 Genexus 集成測(cè)序儀，Genexus 純化系統(tǒng)使用機(jī)載可視化系統(tǒng)來(lái)驗(yàn)證試劑的放置并實(shí)時(shí)檢測(cè)錯(cuò)誤。可視化系統(tǒng)持續(xù)檢查耗材是否適合純化運(yùn)行類型，并有助于防止使用已過(guò)期或之前已用過(guò)的耗材。在系統(tǒng)基座中的屏幕上會(huì)顯示有關(guān)系統(tǒng)中加載耗材的反饋。
MagMAX 技術(shù)
MagMAX 技術(shù)使用磁珠執(zhí)行核酸萃取。MagMAX 磁珠因其較大的表面積可提供出色的結(jié)合性能，接受更大范圍的不同粘度樣品，并且允許小容量樣品的高效洗脫。
48‐孔核酸儲(chǔ)存板
萃取后，所有核酸直接轉(zhuǎn)移至 48‐孔儲(chǔ)存板并在運(yùn)行完成后長(zhǎng)達(dá)一小時(shí)的時(shí)間內(nèi)保持冷卻。48‐孔核酸儲(chǔ)存板帶有條形碼，便于在多個(gè)存儲(chǔ)的儲(chǔ)存板中追蹤樣品提取。
自動(dòng)化定量分析
Genexus 純化系統(tǒng)可使用 Genexus 集成測(cè)序儀實(shí)現(xiàn)萃取核酸的自動(dòng)化定量分析。兩種染料用于檢測(cè)提取樣品中的 DNA 或 RNA 濃度。自動(dòng)化的運(yùn)行后定量分析可節(jié)省手動(dòng)操作時(shí)間，允許在運(yùn)行完成后直接使用萃取樣品進(jìn)行基因分析工作流程。
快速周轉(zhuǎn)
Genexus 純化系統(tǒng)的運(yùn)行時(shí)間從 2 到 5.5 個(gè)小時(shí)不等，具體取決于萃取樣品的數(shù)量和正在運(yùn)行的方案。自動(dòng)化定量分析有助于顯著減少運(yùn)行后的手動(dòng)操作時(shí)間，從而快速過(guò)渡到后續(xù)的基因分析工作流程。
運(yùn)行后清潔
每次運(yùn)行后，研究人員會(huì)丟棄接觸樣本的所有耗材，然后 Genexus 純化系統(tǒng)會(huì)使用紫外光來(lái)清潔工作臺(tái)。自動(dòng)化紫外光清潔可防止可能的運(yùn)行間核酸殘留，這種殘留可能導(dǎo)致下游測(cè)序污染。
額外的工作流程益處
Genexus 純化系統(tǒng)是 Ion Torrent Genexus 系統(tǒng)的組成部分，該系統(tǒng)是個(gè)整體 NGS 解決方案，可自動(dòng)完成從標(biāo)本到報(bào)告的工作流程，并可在一天內(nèi)得出結(jié)果。當(dāng) Genexus 純化系統(tǒng)連接到 Genexus 集成測(cè)序儀后，額外的工作流程益處包括：
Genexus 軟件—Genexus 集成測(cè)序儀的軟件用于計(jì)劃從標(biāo)本到報(bào)告的完整工作流程。研究人員使用該軟件選擇 NGS 測(cè)定并分配待運(yùn)行的樣本。該軟件可從純化到測(cè)序和運(yùn)行后樣品報(bào)告全程追蹤樣本。
NGS 即用型測(cè)序板—當(dāng) Genexus 純化系統(tǒng)連接到 Genexus 集成測(cè)序儀并作為集成工作流程的一環(huán)運(yùn)行時(shí)，每種萃取核酸的預(yù)定義等分試樣會(huì)從儲(chǔ)存板轉(zhuǎn)移到 NGS 即用型 96 孔核酸測(cè)序板，該板可用作樣本輸入至 Genexus 集成測(cè)序儀。
查看濃度—當(dāng) Genexus 凈化系統(tǒng)與 Genexus 集成測(cè)序儀配對(duì)使用并作為集成工作流程的一環(huán)運(yùn)行時(shí)，萃取核酸濃度會(huì)傳輸給 Genexus 軟件。可以設(shè)置測(cè)定特異性核酸濃度閾值，以篩選哪些樣品進(jìn)行測(cè)序，或者在繼續(xù)操作之前可以手動(dòng)檢查提取輸出。核酸濃度檢查可防止浪費(fèi)用于數(shù)量不足樣品的測(cè)序試劑。
免移液轉(zhuǎn)移至 Genexus 集成測(cè)序儀—當(dāng) Genexus 純化系統(tǒng)與 Genexus 集成測(cè)序儀連接并作為集成工作流程的一環(huán)運(yùn)行時(shí)，萃取后核酸濃度會(huì)發(fā)送給集成測(cè)序儀的 Genexus 軟件。NGS 即用型輸出板免移液轉(zhuǎn)移至集成測(cè)序儀，因?yàn)樗峁┑暮怂釢舛仍试S測(cè)序儀將核酸稀釋至測(cè)序工作流程的測(cè)定特定輸入量。
Genexus 純化系統(tǒng)可提供：
•MagMAX 技術(shù)—得出一致的萃取結(jié)果
• 預(yù)填充的耗材—有助于縮短手動(dòng)處理時(shí)間
• 可視化系統(tǒng)—運(yùn)行設(shè)置期間可提供有關(guān)耗材的實(shí)時(shí)反饋，以防止設(shè)置錯(cuò)誤
• 集成的核酸定量分析—縮短運(yùn)行后處理時(shí)間
Genexus 純化系統(tǒng)在 Genexus 集成測(cè)序儀上使用時(shí)，可實(shí)現(xiàn)多種組織類型的自動(dòng)化核酸萃取和定量分析。該純化系統(tǒng)具有單個(gè)觸點(diǎn)和 10 分鐘的手動(dòng)操作時(shí)間，可從 FFPE 裂解物中按順序提取 DNA 和 RNA，從血漿中提取 cfTNA，以及從全血、新鮮或冷凍組織、骨髓或外周血白細(xì)胞中單獨(dú)提取 DNA 或 RNA。Genexus 軟件連接至集成測(cè)序儀后，可集成從設(shè)置到報(bào)告的工作流程至單個(gè)軟件生態(tài)系統(tǒng)中，實(shí)現(xiàn)下一代測(cè)序 (NGS) 工作流程的簡(jiǎn)化。
預(yù)填充試劑
Genexus 純化系統(tǒng)耗材預(yù)填充有執(zhí)行萃取所必需的大多數(shù)試劑，因此每份樣品僅需很少的移液步驟即可設(shè)置運(yùn)行。只需移除箔封，添加酶和您的樣品，然后將耗材放置在儀器上。
可視化系統(tǒng)
就像 Genexus 集成測(cè)序儀，Genexus 純化系統(tǒng)使用機(jī)載可視化系統(tǒng)來(lái)驗(yàn)證試劑的放置并實(shí)時(shí)檢測(cè)錯(cuò)誤。可視化系統(tǒng)持續(xù)檢查耗材是否適合純化運(yùn)行類型，并有助于防止使用已過(guò)期或之前已用過(guò)的耗材。在系統(tǒng)基座中的屏幕上會(huì)顯示有關(guān)系統(tǒng)中加載耗材的反饋。
MagMAX 技術(shù)
MagMAX 技術(shù)使用磁珠執(zhí)行核酸萃取。MagMAX 磁珠因其較大的表面積可提供出色的結(jié)合性能，接受更大范圍的不同粘度樣品，并且允許小容量樣品的高效洗脫。
48‐孔核酸儲(chǔ)存板
萃取后，所有核酸直接轉(zhuǎn)移至 48‐孔儲(chǔ)存板并在運(yùn)行完成后長(zhǎng)達(dá)一小時(shí)的時(shí)間內(nèi)保持冷卻。48‐孔核酸儲(chǔ)存板帶有條形碼，便于在多個(gè)存儲(chǔ)的儲(chǔ)存板中追蹤樣品提取。
自動(dòng)化定量分析
Genexus 純化系統(tǒng)可使用 Genexus 集成測(cè)序儀實(shí)現(xiàn)萃取核酸的自動(dòng)化定量分析。兩種染料用于檢測(cè)提取樣品中的 DNA 或 RNA 濃度。自動(dòng)化的運(yùn)行后定量分析可節(jié)省手動(dòng)操作時(shí)間，允許在運(yùn)行完成后直接使用萃取樣品進(jìn)行基因分析工作流程。
快速周轉(zhuǎn)
Genexus 純化系統(tǒng)的運(yùn)行時(shí)間從 2 到 5.5 個(gè)小時(shí)不等，具體取決于萃取樣品的數(shù)量和正在運(yùn)行的方案。自動(dòng)化定量分析有助于顯著減少運(yùn)行后的手動(dòng)操作時(shí)間，從而快速過(guò)渡到后續(xù)的基因分析工作流程。
運(yùn)行后清潔
每次運(yùn)行后，研究人員會(huì)丟棄接觸樣本的所有耗材，然后 Genexus 純化系統(tǒng)會(huì)使用紫外光來(lái)清潔工作臺(tái)。自動(dòng)化紫外光清潔可防止可能的運(yùn)行間核酸殘留，這種殘留可能導(dǎo)致下游測(cè)序污染。
額外的工作流程益處
Genexus 純化系統(tǒng)是 Ion Torrent Genexus 系統(tǒng)的組成部分，該系統(tǒng)是個(gè)整體 NGS 解決方案，可自動(dòng)完成從標(biāo)本到報(bào)告的工作流程，并可在一天內(nèi)得出結(jié)果。當(dāng) Genexus 純化系統(tǒng)連接到 Genexus 集成測(cè)序儀后，額外的工作流程益處包括：
Genexus 軟件—Genexus 集成測(cè)序儀的軟件用于計(jì)劃從標(biāo)本到報(bào)告的完整工作流程。研究人員使用該軟件選擇 NGS 測(cè)定并分配待運(yùn)行的樣本。該軟件可從純化到測(cè)序和運(yùn)行后樣品報(bào)告全程追蹤樣本。
NGS 即用型測(cè)序板—當(dāng) Genexus 純化系統(tǒng)連接到 Genexus 集成測(cè)序儀并作為集成工作流程的一環(huán)運(yùn)行時(shí)，每種萃取核酸的預(yù)定義等分試樣會(huì)從儲(chǔ)存板轉(zhuǎn)移到 NGS 即用型 96 孔核酸測(cè)序板，該板可用作樣本輸入至 Genexus 集成測(cè)序儀。
查看濃度—當(dāng) Genexus 凈化系統(tǒng)與 Genexus 集成測(cè)序儀配對(duì)使用并作為集成工作流程的一環(huán)運(yùn)行時(shí)，萃取核酸濃度會(huì)傳輸給 Genexus 軟件。可以設(shè)置測(cè)定特異性核酸濃度閾值，以篩選哪些樣品進(jìn)行測(cè)序，或者在繼續(xù)操作之前可以手動(dòng)檢查提取輸出。核酸濃度檢查可防止浪費(fèi)用于數(shù)量不足樣品的測(cè)序試劑。
免移液轉(zhuǎn)移至 Genexus 集成測(cè)序儀—當(dāng) Genexus 純化系統(tǒng)與 Genexus 集成測(cè)序儀連接并作為集成工作流程的一環(huán)運(yùn)行時(shí)，萃取后核酸濃度會(huì)發(fā)送給集成測(cè)序儀的 Genexus 軟件。NGS 即用型輸出板免移液轉(zhuǎn)移至集成測(cè)序儀，因?yàn)樗峁┑暮怂釢舛仍试S測(cè)序儀將核酸稀釋至測(cè)序工作流程的測(cè)定特定輸入量。
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