過氧化氫是一種代謝過程中產(chǎn)生的廢物，它能夠?qū)C體造成損害。為了避免這種損害，過氧化氫必須被快速地轉(zhuǎn)化為其他無害或毒性較小的物質(zhì)。而過氧化氫酶就是常常被細胞用來催化過氧化氫分解的工具。
但過氧化氫酶真正的生物學重要性并不是如此簡單：研究者發(fā)現(xiàn)基因工程改造后的過氧化氫酶缺失的小鼠依然為正常表現(xiàn)型，這就表明過氧化氫酶只是在一些特定條件下才對動物是重要的。
一些人群體內(nèi)的過氧化氫酶水平非常低，但也不顯示出明顯的病理反應。這很有可能是因為正常哺乳動物細胞內(nèi)主要的過氧化氫清除劑是過氧化物還原酶(peroxiredoxin)，而不是過氧化氫酶。
過氧化氫酶通常定位于一種被稱為過氧化物酶體的細胞器中。植物細胞中的過氧化物酶體參與了光呼吸(利用氧氣并生成二氧化碳)和共生性氮固定(將氮氣(N2)解離為活性氮原子)。
但細胞被病原體感染時，過氧化氫可以被用作一種有效的抗微生物試劑。部分病原體，如結核桿菌、嗜肺軍團菌和空腸彎曲菌，能夠生產(chǎn)過氧化氫酶以降解過氧化氫，使得它們能在宿主體內(nèi)存活。
